初诊肺癌患者用PCR还是NGS检测?
初诊肺癌患者用PCR还是NGS检测?●问题本质是NGS或PCR检测的覆盖范围是否能够覆盖癌患者一线用药的突变位点。
●目前肺癌一线靶向药对应的基因突变范围包括:EGFR 19del, L858R, T790M, ex20ins,KRAS G12C,BRAF V600E,MET ex14跳突;ALK 融合,ROS1融合,RET融合,NTRK融合,HER2阳性等。
●NGS对于已知的、未知的点突变,插入缺失、融合、扩增等突变类型都可以检测,PCR只能检测已知的热点突变。比如,ALK 已经有20多种伴侣基因,最常见的伴侣基因是EML4, EML4-ALK融合又有多种融合亚型,区别是融合断点位置不一样,PCR常覆盖EML4发生率较高的断点,罕见的ALK融合,TFG、KIF5B、KLC1、PTPN3、STRN等伴侣基因同样会存在漏检风险,因此,不论是ALK常见的融合还是罕见的融合, PCR漏检的风险都大。NGS 检测ALK 融合是否存在漏检,漏检风险有多大取决于NGS 检测的覆盖范围,整体上,NGS相比PCR检测对ALK 覆盖的范围更大,检出率更高。
●众多其他可靶向的基因,ALK、KRAS、HER2、MET、RET、BRAF、ROS1、NTRK等也有多少类似的情况,不胜枚举。
●所以,初诊的肺癌患者尽量选择NGS 检测获取更多的靶向治疗的机会。
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